Πρόγραμμα Σπουδών

Το Δ.Π.Μ.Σ. (EMJM  MorphoPHEN) διαρθρώνεται σε δύο (2) εξάμηνα.

Στο Α’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30) διδάσκονται δυο διδακτικές ενότητες σε δύο (2) διαφορετικά Πανεπιστημιακά Ιδρύματα. Η 1η Διδακτική Ενότητα (ECTS: 10) διεξάγεται στο Τμήμα Κτηνιατρικής του Αυτόνομου Πανεπιστημίου της Βαρκελώνης και περιλαμβάνει 12 μαθήματα (11 υποχρεωτικά και ένα επιλογής), ενώ η 2η Διδακτική Ενότητα στο Τμήμα Κτηνιατρικής & Ζωικής Παραγωγής του Πανεπιστημίου της Νάπολης Federico II και περιλαμβάνει επτά μαθήματα (έξι υποχρεωτικά και  ένα επιλογής).

Στο Β’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30) διδάσκεται η 3η Διδακτική Ενότητα (ECTS: 20) που διεξάγεται στο Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και περιλαμβάνει  οχτώ μαθήματα (επτά υποχρεωτικά και ένα επιλογής). Θα διδάσκονται επίσης μαθήματα Σχεδιασμού των Πειραματισμών (Experimental Design). Επίσης εκπονείται και η μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία (ECTS: 10) σε ένα από τα Πανεπιστήμια της επιλογής της/του υποψηφίου μεταξύ των UAB,UNINA, AUTH και FMV-ULisboa.

Η επίσημη γλώσσα διεξαγωγής του προγράμματος είναι η αγγλική οπότε και η γλώσσα εκπόνησης της μεταπτυχιακής εργασίας είναι αποκλειστικά η αγγλική.

A’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30)

(Δύο υποχρεωτικές διδακτικές ενότητες)

 

1η Διδακτική Ενότητα (module)

Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής

ECTS

 

Mouse Anatomy & Pathobiology

 

10

α/α

Τίτλος Μαθήματος

Τύπος μαθήματος

Αυτόνομο Πανεπιστήμιο της Βαρκελώνης

(Universitat Autónoma de Barcelona, UAB)

Τμήμα Κτηνιατρικής

1

Mouse status in biomedicine

Υ

2

Standardized nomenclature for mice

Y

3

Anatomical and histological methods

Y

4

Mouse embryology and placenta

Y

5

Gross anatomy and topography in mouse

Y

6

Histology of mouse organs

Y

7

Ultrastructure of mouse tissues

Y

8

Ontological approach to mouse morphology

Y

9

Introduction to general mouse pathology

Y

10

Mouse necropsy

Y

11

Pathology of the major organ systems

Y

12

Optional language (Spanish, Catalan)

E

 

2η Διδακτική Ενότητα

Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής

ECTS

 

Mouse Imaging

 

20

α/α

Τίτλος Μαθήματος

Τύπος μαθήματος

Πανεπιστήμιο της Νάπολης

(Università degli Studi di Napoli Federico II, UNINA)

Τμήμα Κτηνιατρικής &

Ζωικής Παραγωγής και Ινστιτούτο Δομής και Απεικόνισης στις Βιοϊατρικές Επιστήμες

1

Anatomical bases of mouse imaging

Υ

2

Mouse handling, care, and anaesthesia

Υ

3

Imaging using ionizing radiation (X-ray, CT, SPECT, PET)

Υ

4

Imaging using non-ionizing radiation (MRI, FMT, NIR, HFUS, PAI)

Υ

5

Hybrid imaging (PET/CT, PET/MR, US/PAI)

Υ

6

Applications: cell trafficking and cell tissue homing, angiogenesis, hypoxia, apoptosis and inflammation

Υ

7

Optional language course (Italian)

Ε

Β ΄ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30)

(Μια υποχρεωτική διδακτική ενότητα & Διπλωματική Εργασία)

 

3η Διδακτική Ενότητα

Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής

ECTS

 

Deep Learning & Experimental Design

 

20

α/α

Τίτλος Μαθήματος

Τύπος μαθήματος

Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (Α.Π.Θ.)

Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών

1

Introduction to deep and machine learning

Υ

2

Classifiers and metrics for evaluation

Υ

3

Supervised and unsupervised algorithms

Υ

4

Convolutional neural and recurrent networks

Υ

5

Methodologies for 1D and 2D signals: sliding windows, super-pixels, streaming data and whole pictures transformation

Υ

6

Methodologies for conducting deep learning experiments

Υ

7

Experimental design with mouse: quantitative comparison, ARRIVE and 3Rs

Y

8

Optional language course (Greek) y 3Rs

E

 

Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία

Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής

ECTS

   

10

 

Research Project on anatomy, pathology, or deep learning applied to the morphological phenotyping of human diseases mouse models

Υ

Επιλογή του υποψηφίου μεταξύ των:

Πανεπιστήμιο της Λισαβόνας, Κτηνιατρική Σχολή  (Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade de Lisboa , FMV-ULisboa) Τμήμα Ανατομίας & Φυσιολογίας Ζώων, ή Α.Π.Θ ή UNINA ή UAB