Συνοπτική Περιγραφή Μαθημάτων

	1η Διδακτική Ενότητα (module)	Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής	ECTS
	Mouse Anatomy & Pathobiology	Αυτόνομο Πανεπιστήμιο της Βαρκελώνης (Universitat Autónoma de Barcelona, UAB), Τμήμα Κτηνιατρικής	10
α/α	Τίτλος Μαθήματος και περιγραφή
1	Mouse status in biomedicine: Η θέση του μυός στη βιοϊατρική έρευνα είναι θεμελιώδης, για πολλούς λόγους. Στο μάθημα αυτό θα γίνει παρουσίαση αυτών των χαρακτηριστικών, ένα από τα οποία είναι το γεγονός πως οι άνθρωποι και οι μύες μοιράζονται πολλά κοινά γενετικά χαρακτηριστικά και εξετάζοντας τη φυσιολογία, την ανατομία και τον μεταβολισμό ενός μυός, οι επιστήμονες μπορούν να αποκτήσουν μια πολύτιμη εικόνα για τη φυσιολογία του ανθρώπου.
2	Standardized nomenclature for mice: Η γενετική τροποποίηση των μυών έχει γίνει απαραίτητη για τη σωστή επιλογή των ζωικών προτύπων που μιμούνται μια ασθένεια του ανθρώπου. Αυτό το μάθημα θα διδάξει στις/τους φοιτήτριες/τες τον σωστό τρόπο ονοματολογίας των μυών μετά από τις γενετικές τροποποιήσεις που έχουν πραγματοποιηθεί, έτσι ώστε να είναι άμεσα αντιληπτή από τη διεθνή κοινότητα των επιστημόνων.
3	Anatomical and histological methods: στο μάθημα αυτό θα γίνει η παρουσίαση των μεθόδων για τη μακροσκοπική και μικροσκοπική μελέτη των οργάνων του μυός. Αυτές οι τεχνικές είναι απαραίτητες για την εντόπιση και διερεύνηση των οργάνων και συστημάτων του μυός.
4	Mouse embryology and placenta: η εκμάθηση της εμβρυϊκής ανάπτυξης του μυός καθώς και η ανατομική του πλακούντα, είναι σημαντικά στοιχεία για την κατανόηση όχι μόνο φυσιολογικών αλλά και παθολογικών καταστάσεων στον μυ
5	Gross anatomy and topography in mouse: στο μάθημα αυτό θα γίνει η μακροσκοπική παρουσίαση των οργάνων του μυός. Με αυτόν τον τρόπο θα είναι δυνατόν να συγκρίνεται και να αναγνωρίζεται το παθολογικό εύρημα σε περιπτώσεις ασθενειών.
6	Histology of mouse organs: στο μάθημα αυτό θα γίνει η μικροσκοπική παρουσίαση των οργάνων του μυός και των στοιχείων τους. Είναι απαραίτητη γνώση για να πραγματοποιηθεί η παθολογοανατομική εξέταση και διάγνωση των παρασκευασμάτων μετά από κάθε πειραματισμό.
7	Ultrastructure of mouse tissues: σε αυτό το μάθημα θα γίνει η παρουσίαση και η εξέταση των υπερ λεπτών τομών ιστών του μυός. Η ηλεκτρονική μικροσκοπία αποκαλύπτει στοιχεία απαραίτητα για την ανακάλυψη παθογενειών των ασθενειών. Είναι αναγκαία η γνώση των δομών στη φυσιολογική τους κατάσταση για να μπορέσει η/ο ερευνήτρια/ης να ανακαλύψει πιθανή βλάβη που έχει προκληθεί.
8	Ontological approach to mouse morphology: σε αυτό το μάθημα θα γίνει λεπτομερής παρουσίαση της εμβρυολογικής ανάπτυξης των οργάνων του μυός και σύνδεσή τους με πιθανή συγγενή διαμαρτία διάπλασης που οδηγεί σε παθογένειες στο ζώο.
9	Introduction to general mouse pathology: σε αυτό το μάθημα θα γίνει εισαγωγή στην παθολογία του μυός και θα γίνει η πρώτη σύνδεση των φυσιολογικών στοιχείων με πιθανές παθολογικές καταστάσεις για την έγκαιρη και επιτυχή διάγνωση μετά από την εμφάνιση συμπτωμάτων στο ζώο.
10	Mouse necropsy: Η νεκροτομική εξέταση του μυός είναι απαραίτητη για τη διάγνωση των αιτιών που οδήγησαν στο θάνατο του ζώου. Στο μάθημα αυτό θα παρουσιαστούν με λεπτομέρεια όλα τα στάδια της εξέτασης των οργάνων, και η μορφή τους στη φυσιολογική τους κατάσταση με σκοπό να αναγνωρίζεται και η παθολογική τους εμφάνιση.
11	Pathology of the major organ systems: Σε αυτό το μάθημα θα παρουσιαστεί με λεπτομέρεια η παθολογία των βασικών οργάνων του μυός, με λήψη ιστορικού, συμπτωμάτων και πιθανής θεραπείας του ζώου.
12	Optional language (Spanish, Catalan): Πρόκειται για μάθημα επιλογής εκμάθησης της ισπανικής ή/και καταλανικής γλώσσας.
	2η Διδακτική Ενότητα	Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής	ECTS
	Mouse Imaging	Πανεπιστήμιο της Νάπολης (Università degli Studi di Napoli Federico II, UNINA) Τμήμα Κτηνιατρικής & Ζωικής Παραγωγής και Ινστιτούτο Δομής και Απεικόνισης στις Βιολογικές επιστήμες	20
α/α	Τίτλος Μαθήματος και περιγραφή
1	Anatomical bases of mouse imaging: στο μάθημα αυτό θα διδαχθεί όλο το ανατομικό υπόβαθρο των οργάνων και των συστημάτων του μυός που είναι αναγκαία γνώση για την ερμηνεία των απεικονιστικών τεχνικών
2	Mouse handling, care, and anaesthesia: το μάθημα αυτό καλύπτει θέματα συγκράτησης, περιποίησης και αναισθησίας του ζώου. Χωρίς αυτές τις γνώσεις δεν είναι δυνατόν να πραγματοποιηθεί κανείς πειραματικός σχεδιασμός.
3	Imaging using ionizing radiation (X–ray, CT, SPECT, PET): σε αυτό το μάθημα θα πραγματοποιηθεί εκμάθηση τεχνικών απεικόνισης με τη χρήση ιονίζουσας ακτινοβολίας, όπως απλή ακτινογραφία, computed tomography, Single Photon Emission Computed Tomography, Position Emission Tomography.
4	Imaging using non–ionizing radiation (MRI, FMT, NIR, HFUS, PAI): σε αυτό το μάθημα θα πραγματοποιηθεί εκμάθηση τεχνικών απεικόνισης με τη χρήση μη ιονίζουσας ακτινοβολίας, όπως Magnetic Resonance Imaging, Photoacoustic Imaging, υπερηχοτομογραφία, fluorescence molecular tomography και άλλες μορφές απεικόνισης των οργάνων του ζώου
5	Hybrid imaging (PET/CT, PET/MR, US/PAI): σε αυτό το μάθημα θα γίνει εκμάθηση των τεχνικών απεικόνισης που συνδυάζουν όλες τις παραπάνω μεθόδους.
6	Applications: cell trafficking and cell tissue homing, angiogenesis, hypoxia, apoptosis and inflammation: στο μάθημα αυτό θα γίνει η παρουσίαση των εφαρμογών των μεθόδων απεικόνισης όπως η μετακίνηση των κυττάρων, η μετάσταση κυτταρικών ιστών, η αγγιογένεση, η υποξία, η απόπτωση και η φλεγμονή.
7	Optional language course (Italian): Πρόκειται για μάθημα επιλογής εκμάθησης της ιταλικής γλώσσας.
Β ΄ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30) (Μια υποχρεωτική διδακτική ενότητα & Διπλωματική Εργασία)
	3η Διδακτική Ενότητα	Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής	ECTS
	Deep Learning & Experimental Design	Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (Α.Π.Θ.) Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών	20
α/α	Τίτλος Μαθήματος και περιγραφή
1	Introduction to deep and machine learning: στο μάθημα αυτό θα γίνει η εισαγωγή στη βαθιά μάθηση καθώς και στη μάθηση με τη βοήθεια μηχανών για να χρησιμοποιηθούν στη συνέχεια σε σχέση με τη φυσιολογική και παθολογική εμφάνιση του ζώου. Είναι βασικές τεχνικές νεότερης τεχνολογίας που συνδυάζονται όλο και περισσότερο με την πρακτική άσκηση της ιατρικής επιστήμης.
2	Classifiers and metrics for evaluation: σε αυτό το μάθημα θα γίνει παρουσίαση των ταξινομητών και μετρήσεων καθώς και ο τρόπος αξιολόγησής τους.
3	Supervised and unsupervised algorithms: Οι φοιτήτριες/τές θα εξοικειωθούν σε αυτό το μάθημα με τους αλγορίθμους που θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν στην κλινική πράξη που σχετίζεται με την παθολογία του μυός.
4	Convolutional neural and recurrent networks: στο μάθημα αυτό θα γίνει η εκμάθηση των νευρωνικών δικτύων, αλλά και άλλων μορφών δικτύων, τα οποία έχουν εφαρμογή στην πειραματική και κλινική πράξη. Τα δίκτυα αυτά παρέχουν δυνατότητα χρήσης των αποτελεσμάτων από έναν πειραματικό σχεδιασμό και εκπαίδευσή τους για να παραχθεί το δυνητικό αποτέλεσμα μιας εξεργασίας.
5	Methodologies for 1D and 2D signals: sliding windows, super-pixels, streaming data and whole pictures transformation: σε αυτό το μάθημα θα παρουσιαστούν μεθοδολογίες μονοδιάστατες και δισδιάστατες σημάτων που μπορεί να σχετίζονται με ιατρικές πράξεις.
6	Methodologies for conducting deep learning experiments: στο μάθημα αυτό θα παρουσιαστούν μεθοδολογίες για την διεξαγωγή πειραματισμών με τη χρήση της βαθιάς μάθησης.
7	Experimental design with mouse: quantitative comparison, ARRIVE and 3Rs: στο μάθημα αυτό θα γίνει η εκμάθηση του πειραματικού σχεδιασμού με τη χρήση του μυός, μέθοδοι ποσοτικής σύγκρισης αποτελεσμάτων, αλλά και οι αρχές των 3Rs (reduction, refinement, replacement), που πρέπει να ακολουθούνται στους πειραματισμούς.
8	Optional language course (Greek): Πρόκειται για μάθημα επιλογής εκμάθησης της ελληνικής γλώσσας.
	Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία	Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής	ECTS
		Πανεπιστήμιο της Λισαβόνας, Κτηνιατρική Σχολή (Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade de Lisboa , FMV-ULisboa)Τμήμα Ανατομίας & Φυσιολογίας Ζώων ή Α.Π.Θ ή UNINA ή UAB	10
	Research Project on anatomy, pathology, or deep learning applied to the morphological phenotyping of human diseases mouse models